将复杂的 GROMACS 命令行操作转化为直观的图形化向导流程。 专为生物/化学科研实验室打造的专业级分子动力学模拟工作台。
分子动力学引擎
分子对接引擎
专为解决传统分子模拟痛点而设计，提供从构建到分析的全流程图形化解决方案。
将复杂的分子动力学模拟 MD 流程拆解为 8 个标准化步骤，告别繁琐的命令行操作，让科研更加专注。
内置 Streaming 日志输出系统，实时监控 GROMACS 进程状态，异常情况即时反馈，执行过程一目了然。
采用 VS Code 式的项目隔离管理，支持工作区自动扫描、收藏常用项目、快速切换，井井有条。
每一个细节都为分子模拟工作流精心打造
告别复杂命令行，1 步完成完整 MD 模拟
将繁琐的 GROMACS 命令行操作转化为直观的步骤向导。从结构导入到生产 MD， 每一步都有清晰的表单界面和参数说明，让您专注于科研本身。
执行状态一目了然，问题秒级定位
GROMACS 进程的每一行输出都实时呈现在您眼前。语法高亮的日志视图， 配合进度条和状态指示，让漫长的模拟等待不再焦虑。
独立的项目隔离空间，多项目并行无压力
每个模拟任务都是独立的项目。支持工作区扫描、项目收藏、快速访问。
支持 AMBER、CHARMM、OPLS 等主流力场，一键切换
MDP 参数可视化编辑器，无需记忆复杂命令语法
自动检测 CUDA 环境，充分利用显卡算力加速模拟
macOS、Windows、Linux 全平台原生支持
精心调教的深色主题，深夜科研护眼更专注
内置常用分析工具，一键生成 RMSD、RMSF 等关键数据图表
从经典动力学到增强采样，满足不同维度的科研需求
标准蛋白质溶剂化模拟，包括 EM/NVT/NPT/Production MD
自动处理配体拓扑 (ACPYPE)，构建复合物体系
脂双层膜蛋白系统的构建与平衡
针对核酸的特殊力场参数设置与模拟
基于 AutoDock Vina 的可视化对接
基于靶点库的靶点垂钓 (Target Fishing)
模拟外力作用下的蛋白质解折叠或配体解离
计算结合自由能或反应坐标的 PMF
计算蛋白质-配体结合自由能
轨迹降维分析与构象聚类
涵盖从结构预处理到生产模拟的完整 8 步流程
处理蛋白质结构与生成拓扑
定义模拟盒子的大小与类型
在盒子中填充水分子溶剂
中和电荷并设定离子浓度
消除结构中不合理的原子接触
恒温体积控制，平衡温度
恒压温度控制，平衡密度
正式分子动力学模拟跑库
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